Vor längerem hatte ich schon mal einen Beitrag über Skype geschrieben wie man Skype in den Tray minimieren kann. Nach dem ich vor kurzem Skype 5 installiert habe, ist mir eine kleine aber wichtige Einstellung aufgefallen:
Wenn man in den Einstellungen unter “Erweitert” die Checkbox “Skype in der Taskleiste anzeigen, wenn ich angemeldet bin” deselektiert, kann Skype in den Tray minimiert werden.
Ob diese Option auch in den früheren Skype-Versionen enthalten ist, kann ich nicht sagen. In der Version 5 funktioniert dies prächtig.